中国科学院青藏高原研究所是中国科学院院在知识创新工程试点过程中成立的新型研究所。2003年3月3日，中科院正式任命了青藏高原研究所的领导班子成员，12月2日，正式批准了青藏高原研究所的成立。青藏高原研究所实行“一所三部”的运行模式，即研究所分别在北京、拉萨、昆明设立北京部、拉萨部和昆明部。其中，北京部主要负责建立高水平的研究室和开展室内科研工作，以及提供便利的国际学术交流舞台，吸引国际一流研究人才，组建具有国际水平和创新能力的科研队伍等工作，青藏高原研究所多数科研人员将在北京从事科研工作；拉萨部主要负责野外实验研究和支撑系统台站的运行与管理；昆明部主要负责开展极端环境生物种质资源研究和建立种质资源库等工作，昆明部挂靠在中国科学院昆明植物所。青藏高原研究所立足于青藏高原的基础研究，围绕青藏高原隆升过程及其对亚洲和北半球气候环境影响这一核心科学问题，研究青藏高原地球动力学、环境变化、大气与地表过程和极端环境下生物的生态适应性及生物遗传资源等若干领域的国际前沿科学问题，通过独创性的、有重大国际影响的新成果，为适应和改善东亚地区人类生存环境服务。另外，研究所将通过一流的科研水平、一流的科研团队，一流的科研成果将青藏高原研究所建设成为开放型的、组织管理与国际接轨的国际一流水平的研究机构，逐步成为国际青藏高原研究的中心。
研究所师资力量雄厚，有着一支高水平的科研队伍，他们大多有着丰富的研究生培养经验，而且已经或正在承担着研究生培养的任务。目前研究所共有博士生导师14人，硕士生导师12人，并拥有“自然地理学”和“构造地质学”两个博士点。研究所现在有硕士研究生31人、博士研究生23人、博士后12人，已初步展示出青藏高原所培养研究生的实力。
在研究生培养上，青藏高原所将在较高的起点上加大奖学金、助学金的投放力度。研究生在学期间按月享受助学金：硕士生600元/月；博士生800元/月。博士生和完成基础课程学习的硕士生，进入科研助理岗位，并享受400-1000元不等的科研助理津贴。3、研究所将设立优秀奖学金，重奖优秀学生。获奖面较宽，奖励金额为：一等奖博士生1000元/月，硕士生800元/月；二等奖博士生500元/月，硕士生400元/月。此外在学期间研究生还可以申请中科院院长奖学金以及其他各类奖学金。
2006年青藏高原所有“自然地理学”和“构造地质学”两个专业招收硕士学位研究生，分别与中国科学院资源与环境学院和地球科学学院联合招生，计划招生20名。详细招生方向和考试科目见中国科学院研究生院资源与环境学院和地球科学学院招生专业目录。考生报考时，招生单位请选“80001中国科学院研究生院”，院系名称请选“084资源与环境学院”或“083地球科学学院”。青藏高原研究所北京部研究生学习地点在北京。欢迎有志于从事青藏高原研究的优秀毕业生和科研人员报考。
