中国科学院海洋研究所始建于1950年8月1日，是新中国第一个专门从事海洋科学研究的国立机构，是我国海洋科学的发源地。60多年来在我国海洋基础研究领域做出了许多奠基性了和开创性的工作，引领我国海洋科学的发展，目前仍然是我国规模最大、综合实力最强的综合海洋研究机构之一。
研究所拥有实验海洋生物学、海洋生态与环境科学、海洋环流与波动、海洋地质与环境、海洋环境腐蚀与生物污损5个中科院重点实验室以及海洋生物分类与系统演化实验室、深海研究中心，建有国家海洋腐蚀防护工程技术研究中心、海洋生态养殖技术国家地方联合工程实验室、海洋生物制品开发技术国家地方联合工程实验室3个国家级科研平台，牵头组建青岛海洋科学与技术国家实验室的海洋生物学与生物技术、海洋生态与环境科学2个功能实验室，设有学会联合办公室、文献信息中心、科考船运行管理中心、公共技术中心、海洋科学大数据中心、海洋观测网络管理中心、中科院海洋生物标本馆7个研究支撑单元。西海岸新区园区建有科考船岸基支撑平台，江苏南通建有中科院长江口生态站，位于青岛市古镇口军民融合区的中国科学院青岛科教园及中国科学院海洋大科学研究中心正在建设中。
研究所现有在职职工700余人，其中专业技术人员近600人，两院院士3人，博士生导师102人，硕士生导师172人，设有一级博士学位点3个，二级博士学位点9个，硕士学位点10个、专业硕士学位点3个和1个海洋科学博士后流动站。
60多年来，研究所在我国海洋科技主要领域的研究和发展中做出了许多奠基性和开创性的贡献，取得1100余项科研成果，共发表论文11000余篇(其中SCI/EI收录论文3800余篇)，出版专著230余部;授权发明专利近500件。
进入21世纪，海洋再度成为世界关注的焦点。十八大以来，党中央做出了“建设海洋强国”的重大战略部署，习近平总书记强调指出要关心海洋、认识海洋、经略海洋。中国科学院海洋研究所围绕国家“一带一路”战略，依托中国科学院海洋先导科技专项，积极致力于深海技术装备研发、深海研究体系建设及深海极端环境与战略性资源探索的先导性研究。以我国目前最先进的海洋科学综合考察船“科学”号为代表的科考船队，承担了一系列重要的海洋科学考察航次任务，获取了一大批有重要影响力的成果，深海探测技术及科学研究取得了重要突破，使我国有能力真正走向深海大洋。同时，依托从近海到深海，从南海到西太平洋再到印度洋的科学考察研究，海洋所与“一带一路”战略沿线国家也建立了密切的合作关系，为建设海洋强国提供了重要的科技支撑。
未来，中国科学院海洋研究所将继续围绕“建设海洋强国”战略目标，贯彻落实中科院“三个面向”、“四个率先”新时期办院方针，以“出重大成果、出优秀人才、出前瞻思想”为使命，以中国科学院海洋大科学研究中心筹建及海洋研究所与烟台海岸带研究所两所融合发展为契机，努力促进重大成果产出，为早日实现海洋强国以及中华民族伟大复兴的中国梦而努力奋斗!
